Het FAVV neemt voor wat betreft de slachthuizen enkel de praktische organisatie van de terbeschikkingstelling aan de gewesten van de dierenartsen met opdracht op zich.
Het is aan de gewesten om de nodige richtlijnen op te stellen voor deze dierenartsen met zodat duidelijk is wat van hen verwacht wordt betreffende de controles aangaande dierenwelzijn. De gewesten staan voorts in voor de opleiding van en de informatieverstrekking aan deze dierenartsen.
De dierenartsen met opdracht moeten, zonder tussenkomst van het FAVV, de gewesten onmiddellijk informeren over vastgestelde inbreuken gerelateerd aan dierenwelzijn, conform de instructies die zij hierover krijgen van de gewesten. Het opleggen van corrigerende maatregelen of sancties naar aanleiding van inbreuken op het dierenwelzijn hoort integraal toe aan de gewesten en staat onder de bevoegdheid van de betrokken regionale ministers.
Na de gebeurtenissen in Tielt heeft het FAVV ook vergaderingen met de betrokken diensten van de gewesten georganiseerd om te herinneren aan de afspraken gemaakt in de beheerovereenkomst. Hierbij werd opnieuw duidelijk herinnerd wat de taakverdeling tussen het FAVV en de gewestelijke inspecties is.
Het protocol en de beheersovereenkomst werden op initiatief van het FAVV uitgewerkt om de gewesten toe te laten de organisatie van de controles op het dierenwelzijn op een gestructureerde manier over te nemen.
Na bijna drie jaar werking hebben de gewestelijke overheden nooit officieel gevraagd om de werking hiervan te herzien. Het FAVV staat open voor een herziening van het protocol en de beheersovereenkomst. Het FAVV vraagt dan ook dat het overleg hieromtrent zo snel als mogelijk opgestart wordt. Het FAVV blijft voorstander van een constructieve oplossing die de controles zowel op dierenwelzijn als op voedselveiligheid maximaal garanderen waarbij iedereen zijn verantwoordelijkheid opneemt en met respect van de taken van de andere bevoegde diensten.
Daarenboven kunnen de gewestelijke diensten bevoegd voor dierenwelzijn zelf de controles, bovenop deze uitgevoerd door de dierenartsen met opdracht, uitvoeren en uitbreiden.